差不多二周目，去流星瀑布第一层最下面的瀑布有一个石头，旁边有黑洞，进去抓帕鲁奇亚。
看看洞有一层抓迪亚鲁卡。去落日火山最高层的墓碑那进入反转世界，抓冥王龙。
下面是每只神兽和一些人气PM的捕获地，括号内为遇到的等级（出现率都为能设置到的最低）：
超神兽（80）、洛奇亚（70）、凤王（70）：归来洞穴能遇到65级大嘴蝠、66级钢人、65级3D龙Z的房间（东西方文化的最高神兽放一起了- -）
超梦（70）、梦幻（30）、冥王龙（70）：归来洞穴能遇到55级大嘴蝠、56级钢人、55级3D龙2的房间
古拉顿（70）、海皇牙（70）、裂空座（70）：归来洞穴能遇到45级大嘴蝠、46级钢人、45级3D龙的房间
迪亚路加（47）、帕陆基亚（47）、迪奥西斯（50）：殿元山洞穴最高的两层（即F6、F7）
三只蘑菇（50）：殿元山洞穴倒数第3、4层（即F4、F5）
圣柱王（70）：冰雪神殿最后3层（即B3、B4、B5）
岩神柱（50）：冰雪神殿第1层（即F1）
冰神柱（50）：冰雪神殿第2层（即B1）
钢神柱（50）：冰雪神殿第3层（即B2）
火钢兽（70）、炎帝（50）、火焰鸟（50）：坚硬火山洞穴内层（2F）
吉拉奇（30）：坚硬火山洞穴第一层（1F）
闪电鸟（50）、玛娜菲（30）：226号道路草地
急冻鸟（50）：殿元山中段の下雪地带
雷皇（50）、钢螃蟹（50）、血翼飞龙（50）：224号道路草地
水君（50）：律诗湖水面
雪拉比（5）：白岱森林
拉迪亚斯（50）：223号水道水面
拉迪奥斯（50）：220号水道水面
草刺猬（30）、黑啸灵（40）、美梦兽（50）：230号道路草地
快龙（55）：230号道路水面
刺龙王（55）：226号道路水面
巨甲（60）、重甲暴龙（55）、沙暴龙（55）：228号道路
耿鬼（20）：鬼屋中有红眼睛壁画的房间
鬼盆栽（25）：鬼屋玄关和食堂
电弧灵（25）：鬼屋中除了有红眼睛壁画的房间、食堂和玄关的任何房间
卡比兽（50）：222号道路草地
快乐蛋（20）、奶牛（18）：209号道路
大猩猩（55）：馈赠之泉
美娜斯（40）、笨笨鱼（30）：殿元山瀑布处水面（不是用钓鱼哦）
钻石珍珠3主角（5）：201号道路
宝石3主角（5）：202号道路
金银3主角（5）：204号道路
红黄蓝绿3主角（5）：203号道路
4代主角的最终形态：归来洞穴
以下是进化方式的修改，经过这样的修改，有些需要通信进化的精灵可以单机进化了：
1蚊香蛙进化成牛蛙君的方法改为40级进化
2勇吉拉42级进化成胡地、豪力42级进化成怪力、隆隆石42级进化成隆隆岩、鬼斯通42级进化成耿鬼、大岩蛇42级进化成大钢蛇、飞天螳螂40级进化成巨钳螳螂、电击兽40级进化成电击魔、鸭嘴火龙40级进化成鸭嘴暴龙
3呆呆兽使用水石进化成河马王
4铁甲暴龙50级进化成重甲暴龙、海刺龙50级进化成刺龙王、木乃伊50级进化成冥乃伊
5 3D龙30级进化成3D龙2，3D龙2到达50级进化成3D龙Z
6珍珠贝40级进化成猎斑鱼/使用水石进化成樱花鱼
3其他的一些改动：
战斗边境神兽全开放，什么海皇牙、洛奇亚、帕陆基亚、超神兽通通可以带进去
野生超神兽和洛奇亚身上带有大师球- -
迪亚路加身上带有金刚石、帕陆基亚身上带有白玉
两水都身上都带有心之水滴
定点捕捉
神兽:
急冻鸟：114号道路瀑布上面的洞穴内
闪电鸟：流星瀑布最深处
火焰鸟：冠军之路
超梦：石之洞窟推石进入的洞里，与NPC对话选否获得破坏基因，之后去120号道路沉寂之窟
梦幻：领取超梦身上的古代海图，通关后坐船
雷公：新紫堇
炎帝：炎之秘道
水君：彩幽市瀑布洞
洛奇亚：抓完三鸟去116道路的瀑布上的洞穴
凤王：抓完三兽去116道路的瀑布上的洞穴
雪拉比：通关后橙华森林湖中心的森林，击败坂木后捕捉
雷吉洛克：激活海底遗迹后111号道路沙漠地下的洞穴
雷吉艾斯：激活海底遗迹后105号道路的洞穴
雷吉斯奇鲁：激活海底遗迹后120号道路的洞穴
（通关）海皇牙：同原版，通关后天气研究所
（通关）古拉顿：同原版，通关后天气研究所
（通关）裂空座：同原版，剧情后，天空之柱
（通关）拉迪亚斯、拉帝欧斯：全地图随机遇、在水静市水手处得到海图，坐船
基拉祈：绿岭市白色岩石
（通关）迪奥西斯：梦世界联盟获得冠军，获得船票
（通关）席多蓝恩：梦世界往下冲浪到达的红莲之窟
雷吉奇卡斯：抓完雷吉洛克，雷吉艾斯，雷吉斯奇鲁后的海底遗迹
迪亚鲁卡：发生赤日剧情后浅滩洞窟（是否退潮都可到达，但路线不同）
帕鲁奇亚：发生赤日剧情后流星瀑布
基拉帝纳：抓到超梦后到送神火山塔内顶楼，调查墓碑到达反转世界后的尽头遇到
（通关）克蕾塞莉娅：通关后水静市旅馆得到羽毛后去古辰镇睡觉
达克莱伊：橙华森林洋屋得到羽毛，通关后在水静市睡觉，捕捉后进入赤日剧情，击败赤日后开启迪亚鲁卡和帕鲁奇亚的捕获地点
（通关）玛娜菲：琉璃岛水底，一直往上游至尽头，浮出到达深海之殿，击败水梧桐后捕获
赛伊米：捕获基拉帝纳后的轮回镇一青年处获得冥界之花，再与绿荫镇一女人对话，最后去117号道路的花之海里
阿尔宙斯：捕获迪亚鲁卡，帕鲁奇亚和基拉帝纳后觉醒神殿
（通关）维库提尼：通关后烟突山缆车屋后洞口，击败赤焰松后捕捉
（通关）烈希拉姆：梦世界往下冲浪最远处幻龙之塔左边的塔顶
（通关）捷克罗姆：梦世界往下冲浪最远处幻龙之塔右边的塔顶
（通关）雷姆：抓完雷希拉姆，捷克罗姆后幻龙之塔中间的塔顶，击败盖奇斯后捕获
（通关）凯尔迪奥：梦世界梦之城一直往右边走的谅解之路尽头
盖诺塞克特：反转世界断罪之间
其他:
皮卡丘色的皮丘:121号道路
红色暴鲤龙:沙狐乐园某个水池
暗黑洛奇亚:废弃船深处
（通关）水晶大岩蛇:战斗边疆艺术之洞2L冰岩
（通关）紫色佐罗亚克：梦世界魅影之森
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