小智和小茂的秘密基地：通关后的115号道路，流星瀑布出口。
渡的秘密基地：通关后的120号道路。
希罗娜的秘密基地：通关后的119号道路，气象研究所右下方冲浪，再往右下方走。
阿戴克和艾丽丝的秘密基地：通关后的111号道路，沙漠上方。
扩展资料：
已知有三个周目，一周目流程里加入火箭队剧情，二周目有新的八个道馆、新的联盟、银河团和等离子团、一个隐藏道馆（恶属性），三周目将有类似黑白2的PWT的对战设施魅影摩天楼，可以挑战历代馆主、四天王和冠军（包括只担任了很短时间的小茂、小智和N）。
参考资料：搜狗百科――口袋妖怪漆黑的魅影5.0
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